氣動式過濾：在此種過濾系統中比較有名的應該算是惠宏產的水妖精，原理是利用氣舉使水流入過濾體(生化棉、過濾棉)中，進行生物過濾過程。過濾效果還算可以，但是一般須要配合上濾等物理過濾系統使用。多用于小型的繁殖缸、孔雀、短鯛等較少量、小型的魚缸內。

滴流與滲流： 滴流式過濾，這種過濾系統多用于溢流式過濾器或上部式滴流盒，其主要特征在于濾材大部份暴露天空氣里，濾材主要以陶瓷環、生化球、過濾棉為過濾材質，進行生化過濾過程，過濾倉內有流動空氣，但無物理過濾的功能。 滲流式過濾 ，濾材通常為濾棉、生化棉、底砂。主要的特征為濾材基本浸于水體之中，不與空氣直接接觸，起到物理過濾過程，但是在生化棉和底砂之間有較大的空隙，可為消化提供良好的生存環境，也有一定的生化過濾能力。這兩種過濾系統的過濾效果都很好，但也有缺點，滴流過濾需要在魚缸上部占較大的一塊空間，也不美觀。

魚缸里的水會因魚類的糞便、食物殘渣、水草腐葉而受到污染。在人們想象中將水中看得見的懸浮物過濾掉，使水保持清澈透明就已達到目的，其實這僅僅只是過濾的初級功能，我們通常稱之為機械過濾?，F代的觀賞魚缸過濾應是同時具有機械過濾和生物過濾，有時還需要物理過濾。其中尤為重要的是生物過濾。所謂生物過濾，就是通過附著在濾材上的，將溶解在水中的有害物質分解或轉化為無害物質。物理過濾則是利用某些材料特有的吸附功能使水凈化。物理過濾只在特殊情況下短時間使用，如為了去除水中的剩余藥劑等。

太小的缸，或沒有條件添加除油膜硬件，可以放一些“黑瑪莉”，這種上層魚，總是在水面上找食物，同時吞食油膜。也可以定期用一個小杯子壓入水中，杯口貼近水面，讓水面的水溢流到杯中，手工清除油膜。